Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFW7

Lpp, Lipoma-preferred partner homolog, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LppQ8BFW7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LppQ8BFW7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LppQ8BFW7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LppQ8BFW7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LppQ8BFW7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LppQ8BFW7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LppQ8BFW7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LppQ8BFW7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LppQ8BFW7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LppQ8BFW7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LppQ8BFW7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LppQ8BFW7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LppQ8BFW7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LppQ8BFW7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LppQ8BFW7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LppQ8BFW7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LppQ8BFW7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LppQ8BFW7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LppQ8BFW7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LppQ8BFW7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LppQ8BFW7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LppQ8BFW7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LppQ8BFW7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LppQ8BFW7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LppQ8BFW7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LppQ8BFW7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LppQ8BFW7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LppQ8BFW7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LppQ8BFW7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LppQ8BFW7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LppQ8BFW7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LppQ8BFW7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LppQ8BFW7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LppQ8BFW7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LppQ8BFW7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LppQ8BFW7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LppQ8BFW7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LppQ8BFW7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LppQ8BFW7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LppQ8BFW7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LppQ8BFW7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LppQ8BFW7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LppQ8BFW7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LppQ8BFW7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LppQ8BFW7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LppQ8BFW7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LppQ8BFW7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LppQ8BFW7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LppQ8BFW7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LppQ8BFW7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LppQ8BFW7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LppQ8BFW7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LppQ8BFW7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LppQ8BFW7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LppQ8BFW7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LppQ8BFW7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LppQ8BFW7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LppQ8BFW7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LppQ8BFW7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LppQ8BFW7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LppQ8BFW7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LppQ8BFW7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LppQ8BFW7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LppQ8BFW7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LppQ8BFW7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LppQ8BFW7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LppQ8BFW7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LppQ8BFW7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LppQ8BFW7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LppQ8BFW7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LppQ8BFW7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LppQ8BFW7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LppQ8BFW7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LppQ8BFW7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LppQ8BFW7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LppQ8BFW7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LppQ8BFW7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LppQ8BFW7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LppQ8BFW7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LppQ8BFW7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LppQ8BFW7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LppQ8BFW7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms