Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc172Q810N9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc172Q810N9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc172Q810N9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc172Q810N9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc172Q810N9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc172Q810N9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc172Q810N9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc172Q810N9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc172Q810N9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc172Q810N9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc172Q810N9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc172Q810N9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc172Q810N9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc172Q810N9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc172Q810N9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc172Q810N9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc172Q810N9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc172Q810N9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc172Q810N9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc172Q810N9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc172Q810N9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc172Q810N9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc172Q810N9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc172Q810N9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc172Q810N9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc172Q810N9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc172Q810N9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc172Q810N9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc172Q810N9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc172Q810N9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc172Q810N9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc172Q810N9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc172Q810N9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc172Q810N9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc172Q810N9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc172Q810N9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc172Q810N9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc172Q810N9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc172Q810N9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc172Q810N9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc172Q810N9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc172Q810N9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc172Q810N9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc172Q810N9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc172Q810N9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc172Q810N9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc172Q810N9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc172Q810N9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc172Q810N9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc172Q810N9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc172Q810N9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc172Q810N9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc172Q810N9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc172Q810N9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc172Q810N9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc172Q810N9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc172Q810N9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc172Q810N9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc172Q810N9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc172Q810N9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc172Q810N9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc172Q810N9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc172Q810N9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc172Q810N9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc172Q810N9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc172Q810N9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc172Q810N9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc172Q810N9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc172Q810N9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc172Q810N9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc172Q810N9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc172Q810N9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc172Q810N9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc172Q810N9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc172Q810N9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc172Q810N9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc172Q810N9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc172Q810N9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc172Q810N9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc172Q810N9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc172Q810N9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms