Protein–RNA interactions for Protein: Q80X53

Ccdc116, Coiled-coil domain-containing protein 116, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc116Q80X53 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc116Q80X53 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc116Q80X53 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc116Q80X53 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc116Q80X53 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc116Q80X53 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc116Q80X53 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc116Q80X53 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc116Q80X53 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc116Q80X53 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc116Q80X53 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc116Q80X53 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc116Q80X53 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc116Q80X53 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc116Q80X53 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc116Q80X53 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc116Q80X53 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc116Q80X53 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc116Q80X53 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc116Q80X53 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc116Q80X53 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc116Q80X53 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc116Q80X53 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc116Q80X53 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc116Q80X53 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc116Q80X53 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc116Q80X53 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc116Q80X53 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc116Q80X53 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc116Q80X53 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc116Q80X53 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc116Q80X53 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc116Q80X53 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc116Q80X53 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc116Q80X53 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc116Q80X53 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc116Q80X53 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc116Q80X53 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc116Q80X53 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc116Q80X53 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc116Q80X53 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc116Q80X53 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc116Q80X53 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc116Q80X53 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc116Q80X53 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc116Q80X53 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc116Q80X53 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc116Q80X53 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc116Q80X53 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc116Q80X53 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc116Q80X53 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc116Q80X53 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc116Q80X53 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc116Q80X53 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc116Q80X53 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms