Protein–RNA interactions for Protein: Q80U58

Pum2, Pumilio homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum2Q80U58 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pum2Q80U58 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pum2Q80U58 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pum2Q80U58 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pum2Q80U58 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pum2Q80U58 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pum2Q80U58 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pum2Q80U58 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pum2Q80U58 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pum2Q80U58 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pum2Q80U58 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pum2Q80U58 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pum2Q80U58 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pum2Q80U58 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pum2Q80U58 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pum2Q80U58 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pum2Q80U58 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pum2Q80U58 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pum2Q80U58 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pum2Q80U58 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pum2Q80U58 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pum2Q80U58 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pum2Q80U58 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pum2Q80U58 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pum2Q80U58 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pum2Q80U58 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pum2Q80U58 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pum2Q80U58 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pum2Q80U58 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pum2Q80U58 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pum2Q80U58 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pum2Q80U58 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pum2Q80U58 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pum2Q80U58 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms