Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ClmQ7TSN2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ClmQ7TSN2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ClmQ7TSN2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ClmQ7TSN2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ClmQ7TSN2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ClmQ7TSN2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ClmQ7TSN2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ClmQ7TSN2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ClmQ7TSN2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ClmQ7TSN2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ClmQ7TSN2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ClmQ7TSN2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ClmQ7TSN2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ClmQ7TSN2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ClmQ7TSN2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ClmQ7TSN2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ClmQ7TSN2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ClmQ7TSN2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ClmQ7TSN2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ClmQ7TSN2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ClmQ7TSN2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ClmQ7TSN2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ClmQ7TSN2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ClmQ7TSN2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ClmQ7TSN2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ClmQ7TSN2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ClmQ7TSN2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ClmQ7TSN2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ClmQ7TSN2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms