Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ShprhQ7TPQ3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ShprhQ7TPQ3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ShprhQ7TPQ3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ShprhQ7TPQ3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
ShprhQ7TPQ3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ShprhQ7TPQ3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ShprhQ7TPQ3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ShprhQ7TPQ3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ShprhQ7TPQ3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ShprhQ7TPQ3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ShprhQ7TPQ3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ShprhQ7TPQ3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ShprhQ7TPQ3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ShprhQ7TPQ3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ShprhQ7TPQ3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
ShprhQ7TPQ3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ShprhQ7TPQ3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ShprhQ7TPQ3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ShprhQ7TPQ3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ShprhQ7TPQ3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ShprhQ7TPQ3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ShprhQ7TPQ3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
ShprhQ7TPQ3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ShprhQ7TPQ3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ShprhQ7TPQ3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ShprhQ7TPQ3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ShprhQ7TPQ3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ShprhQ7TPQ3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ShprhQ7TPQ3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ShprhQ7TPQ3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ShprhQ7TPQ3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ShprhQ7TPQ3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ShprhQ7TPQ3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ShprhQ7TPQ3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ShprhQ7TPQ3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ShprhQ7TPQ3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ShprhQ7TPQ3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ShprhQ7TPQ3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ShprhQ7TPQ3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ShprhQ7TPQ3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ShprhQ7TPQ3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ShprhQ7TPQ3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ShprhQ7TPQ3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ShprhQ7TPQ3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ShprhQ7TPQ3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ShprhQ7TPQ3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ShprhQ7TPQ3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ShprhQ7TPQ3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ShprhQ7TPQ3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ShprhQ7TPQ3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ShprhQ7TPQ3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ShprhQ7TPQ3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ShprhQ7TPQ3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ShprhQ7TPQ3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ShprhQ7TPQ3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ShprhQ7TPQ3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ShprhQ7TPQ3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ShprhQ7TPQ3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ShprhQ7TPQ3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ShprhQ7TPQ3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ShprhQ7TPQ3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ShprhQ7TPQ3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ShprhQ7TPQ3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ShprhQ7TPQ3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ShprhQ7TPQ3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ShprhQ7TPQ3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
ShprhQ7TPQ3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ShprhQ7TPQ3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ShprhQ7TPQ3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ShprhQ7TPQ3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ShprhQ7TPQ3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ShprhQ7TPQ3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ShprhQ7TPQ3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ShprhQ7TPQ3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ShprhQ7TPQ3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ShprhQ7TPQ3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ShprhQ7TPQ3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
ShprhQ7TPQ3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
ShprhQ7TPQ3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ShprhQ7TPQ3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ShprhQ7TPQ3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ShprhQ7TPQ3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ShprhQ7TPQ3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ShprhQ7TPQ3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ShprhQ7TPQ3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
ShprhQ7TPQ3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
ShprhQ7TPQ3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ShprhQ7TPQ3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ShprhQ7TPQ3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ShprhQ7TPQ3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ShprhQ7TPQ3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ShprhQ7TPQ3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ShprhQ7TPQ3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ShprhQ7TPQ3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ShprhQ7TPQ3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ShprhQ7TPQ3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ShprhQ7TPQ3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ShprhQ7TPQ3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ShprhQ7TPQ3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms