Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMA4

Ffar4, Free fatty acid receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ffar4Q7TMA4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ffar4Q7TMA4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ffar4Q7TMA4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ffar4Q7TMA4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ffar4Q7TMA4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ffar4Q7TMA4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ffar4Q7TMA4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ffar4Q7TMA4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ffar4Q7TMA4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ffar4Q7TMA4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ffar4Q7TMA4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ffar4Q7TMA4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ffar4Q7TMA4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ffar4Q7TMA4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ffar4Q7TMA4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ffar4Q7TMA4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ffar4Q7TMA4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ffar4Q7TMA4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ffar4Q7TMA4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ffar4Q7TMA4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ffar4Q7TMA4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ffar4Q7TMA4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ffar4Q7TMA4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ffar4Q7TMA4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ffar4Q7TMA4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ffar4Q7TMA4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ffar4Q7TMA4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ffar4Q7TMA4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ffar4Q7TMA4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ffar4Q7TMA4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ffar4Q7TMA4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ffar4Q7TMA4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ffar4Q7TMA4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ffar4Q7TMA4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ffar4Q7TMA4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ffar4Q7TMA4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ffar4Q7TMA4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ffar4Q7TMA4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ffar4Q7TMA4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ffar4Q7TMA4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ffar4Q7TMA4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ffar4Q7TMA4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ffar4Q7TMA4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ffar4Q7TMA4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ffar4Q7TMA4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ffar4Q7TMA4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ffar4Q7TMA4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ffar4Q7TMA4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ffar4Q7TMA4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ffar4Q7TMA4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ffar4Q7TMA4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ffar4Q7TMA4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ffar4Q7TMA4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ffar4Q7TMA4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ffar4Q7TMA4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ffar4Q7TMA4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ffar4Q7TMA4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ffar4Q7TMA4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ffar4Q7TMA4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ffar4Q7TMA4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ffar4Q7TMA4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms