Protein–RNA interactions for Protein: Q7M760

Zranb1, Ubiquitin thioesterase Zranb1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zranb1Q7M760 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Zranb1Q7M760 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Zranb1Q7M760 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Zranb1Q7M760 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Zranb1Q7M760 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Zranb1Q7M760 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Zranb1Q7M760 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Zranb1Q7M760 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Zranb1Q7M760 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Zranb1Q7M760 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Zranb1Q7M760 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Zranb1Q7M760 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Zranb1Q7M760 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Zranb1Q7M760 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Zranb1Q7M760 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Zranb1Q7M760 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Zranb1Q7M760 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Zranb1Q7M760 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Zranb1Q7M760 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Zranb1Q7M760 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Zranb1Q7M760 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Zranb1Q7M760 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Zranb1Q7M760 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Zranb1Q7M760 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Zranb1Q7M760 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Zranb1Q7M760 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Zranb1Q7M760 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Zranb1Q7M760 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Zranb1Q7M760 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Zranb1Q7M760 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Zranb1Q7M760 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Zranb1Q7M760 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Zranb1Q7M760 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Zranb1Q7M760 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Zranb1Q7M760 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Zranb1Q7M760 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Zranb1Q7M760 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Zranb1Q7M760 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Zranb1Q7M760 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Zranb1Q7M760 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Zranb1Q7M760 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Zranb1Q7M760 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Zranb1Q7M760 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Zranb1Q7M760 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Zranb1Q7M760 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Zranb1Q7M760 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Zranb1Q7M760 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Zranb1Q7M760 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Zranb1Q7M760 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Zranb1Q7M760 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Zranb1Q7M760 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Zranb1Q7M760 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Zranb1Q7M760 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Zranb1Q7M760 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Zranb1Q7M760 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Zranb1Q7M760 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Zranb1Q7M760 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Zranb1Q7M760 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Zranb1Q7M760 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Zranb1Q7M760 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Zranb1Q7M760 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Zranb1Q7M760 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Zranb1Q7M760 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Zranb1Q7M760 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Zranb1Q7M760 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Zranb1Q7M760 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Zranb1Q7M760 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Zranb1Q7M760 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Zranb1Q7M760 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Zranb1Q7M760 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Zranb1Q7M760 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Zranb1Q7M760 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Zranb1Q7M760 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Zranb1Q7M760 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Zranb1Q7M760 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Zranb1Q7M760 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Zranb1Q7M760 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Zranb1Q7M760 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Zranb1Q7M760 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Zranb1Q7M760 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Zranb1Q7M760 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Zranb1Q7M760 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Zranb1Q7M760 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Zranb1Q7M760 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Zranb1Q7M760 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Zranb1Q7M760 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Zranb1Q7M760 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Zranb1Q7M760 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Zranb1Q7M760 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Zranb1Q7M760 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Zranb1Q7M760 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Zranb1Q7M760 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Zranb1Q7M760 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Zranb1Q7M760 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Zranb1Q7M760 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Zranb1Q7M760 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Zranb1Q7M760 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Zranb1Q7M760 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Zranb1Q7M760 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Zranb1Q7M760 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms