Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snd1Q78PY7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snd1Q78PY7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snd1Q78PY7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snd1Q78PY7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snd1Q78PY7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snd1Q78PY7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snd1Q78PY7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snd1Q78PY7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snd1Q78PY7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snd1Q78PY7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snd1Q78PY7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snd1Q78PY7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snd1Q78PY7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snd1Q78PY7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snd1Q78PY7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snd1Q78PY7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snd1Q78PY7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snd1Q78PY7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snd1Q78PY7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Snd1Q78PY7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snd1Q78PY7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snd1Q78PY7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snd1Q78PY7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snd1Q78PY7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snd1Q78PY7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snd1Q78PY7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snd1Q78PY7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snd1Q78PY7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snd1Q78PY7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Snd1Q78PY7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snd1Q78PY7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Snd1Q78PY7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Snd1Q78PY7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snd1Q78PY7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snd1Q78PY7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snd1Q78PY7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snd1Q78PY7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snd1Q78PY7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snd1Q78PY7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snd1Q78PY7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snd1Q78PY7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snd1Q78PY7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snd1Q78PY7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snd1Q78PY7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snd1Q78PY7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snd1Q78PY7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snd1Q78PY7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snd1Q78PY7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snd1Q78PY7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snd1Q78PY7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snd1Q78PY7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snd1Q78PY7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Snd1Q78PY7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snd1Q78PY7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snd1Q78PY7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snd1Q78PY7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms