Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Higd1cQ76I25 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Higd1cQ76I25 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Higd1cQ76I25 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Higd1cQ76I25 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Higd1cQ76I25 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Higd1cQ76I25 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Higd1cQ76I25 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Higd1cQ76I25 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Higd1cQ76I25 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Higd1cQ76I25 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Higd1cQ76I25 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Higd1cQ76I25 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Higd1cQ76I25 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Higd1cQ76I25 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Higd1cQ76I25 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Higd1cQ76I25 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Higd1cQ76I25 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Higd1cQ76I25 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Higd1cQ76I25 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Higd1cQ76I25 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Higd1cQ76I25 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Higd1cQ76I25 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Higd1cQ76I25 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Higd1cQ76I25 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Higd1cQ76I25 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Higd1cQ76I25 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Higd1cQ76I25 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Higd1cQ76I25 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Higd1cQ76I25 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Higd1cQ76I25 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Higd1cQ76I25 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Higd1cQ76I25 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Higd1cQ76I25 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Higd1cQ76I25 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms