Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Nup188Q6ZQH8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nup188Q6ZQH8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nup188Q6ZQH8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nup188Q6ZQH8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nup188Q6ZQH8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nup188Q6ZQH8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nup188Q6ZQH8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nup188Q6ZQH8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nup188Q6ZQH8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nup188Q6ZQH8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nup188Q6ZQH8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nup188Q6ZQH8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nup188Q6ZQH8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nup188Q6ZQH8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nup188Q6ZQH8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nup188Q6ZQH8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nup188Q6ZQH8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nup188Q6ZQH8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nup188Q6ZQH8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nup188Q6ZQH8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nup188Q6ZQH8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nup188Q6ZQH8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nup188Q6ZQH8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nup188Q6ZQH8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nup188Q6ZQH8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nup188Q6ZQH8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nup188Q6ZQH8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nup188Q6ZQH8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nup188Q6ZQH8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nup188Q6ZQH8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nup188Q6ZQH8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nup188Q6ZQH8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nup188Q6ZQH8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Nup188Q6ZQH8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup188Q6ZQH8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nup188Q6ZQH8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Nup188Q6ZQH8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Nup188Q6ZQH8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nup188Q6ZQH8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nup188Q6ZQH8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nup188Q6ZQH8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup188Q6ZQH8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nup188Q6ZQH8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nup188Q6ZQH8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup188Q6ZQH8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup188Q6ZQH8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nup188Q6ZQH8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nup188Q6ZQH8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup188Q6ZQH8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nup188Q6ZQH8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup188Q6ZQH8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nup188Q6ZQH8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Nup188Q6ZQH8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup188Q6ZQH8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup188Q6ZQH8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nup188Q6ZQH8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nup188Q6ZQH8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nup188Q6ZQH8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nup188Q6ZQH8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup188Q6ZQH8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup188Q6ZQH8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nup188Q6ZQH8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nup188Q6ZQH8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nup188Q6ZQH8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Nup188Q6ZQH8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nup188Q6ZQH8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nup188Q6ZQH8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nup188Q6ZQH8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nup188Q6ZQH8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nup188Q6ZQH8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nup188Q6ZQH8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nup188Q6ZQH8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nup188Q6ZQH8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Nup188Q6ZQH8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Nup188Q6ZQH8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nup188Q6ZQH8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Nup188Q6ZQH8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Nup188Q6ZQH8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nup188Q6ZQH8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup188Q6ZQH8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nup188Q6ZQH8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nup188Q6ZQH8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nup188Q6ZQH8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nup188Q6ZQH8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup188Q6ZQH8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup188Q6ZQH8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nup188Q6ZQH8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nup188Q6ZQH8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nup188Q6ZQH8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nup188Q6ZQH8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nup188Q6ZQH8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms