Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Kcnt1Q6ZPR4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnt1Q6ZPR4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnt1Q6ZPR4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Kcnt1Q6ZPR4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Kcnt1Q6ZPR4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Kcnt1Q6ZPR4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcnt1Q6ZPR4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Kcnt1Q6ZPR4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Kcnt1Q6ZPR4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Kcnt1Q6ZPR4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcnt1Q6ZPR4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcnt1Q6ZPR4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Kcnt1Q6ZPR4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kcnt1Q6ZPR4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Kcnt1Q6ZPR4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kcnt1Q6ZPR4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kcnt1Q6ZPR4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Kcnt1Q6ZPR4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kcnt1Q6ZPR4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kcnt1Q6ZPR4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kcnt1Q6ZPR4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kcnt1Q6ZPR4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kcnt1Q6ZPR4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Kcnt1Q6ZPR4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kcnt1Q6ZPR4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kcnt1Q6ZPR4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kcnt1Q6ZPR4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kcnt1Q6ZPR4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kcnt1Q6ZPR4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Kcnt1Q6ZPR4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kcnt1Q6ZPR4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnt1Q6ZPR4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnt1Q6ZPR4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnt1Q6ZPR4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kcnt1Q6ZPR4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Kcnt1Q6ZPR4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcnt1Q6ZPR4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnt1Q6ZPR4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnt1Q6ZPR4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnt1Q6ZPR4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnt1Q6ZPR4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcnt1Q6ZPR4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnt1Q6ZPR4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnt1Q6ZPR4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnt1Q6ZPR4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcnt1Q6ZPR4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcnt1Q6ZPR4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnt1Q6ZPR4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnt1Q6ZPR4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnt1Q6ZPR4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnt1Q6ZPR4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnt1Q6ZPR4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnt1Q6ZPR4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnt1Q6ZPR4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnt1Q6ZPR4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnt1Q6ZPR4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnt1Q6ZPR4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnt1Q6ZPR4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnt1Q6ZPR4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnt1Q6ZPR4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnt1Q6ZPR4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kcnt1Q6ZPR4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnt1Q6ZPR4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnt1Q6ZPR4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnt1Q6ZPR4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnt1Q6ZPR4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnt1Q6ZPR4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnt1Q6ZPR4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnt1Q6ZPR4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnt1Q6ZPR4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcnt1Q6ZPR4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcnt1Q6ZPR4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcnt1Q6ZPR4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcnt1Q6ZPR4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcnt1Q6ZPR4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnt1Q6ZPR4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnt1Q6ZPR4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms