Protein–RNA interactions for Protein: Q6XJV4

Cd200r4, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r4Q6XJV4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd200r4Q6XJV4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd200r4Q6XJV4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd200r4Q6XJV4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd200r4Q6XJV4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd200r4Q6XJV4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd200r4Q6XJV4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd200r4Q6XJV4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd200r4Q6XJV4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd200r4Q6XJV4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd200r4Q6XJV4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd200r4Q6XJV4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd200r4Q6XJV4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd200r4Q6XJV4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd200r4Q6XJV4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd200r4Q6XJV4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd200r4Q6XJV4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd200r4Q6XJV4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms