Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxcl3Q6W5C0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl3Q6W5C0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxcl3Q6W5C0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl3Q6W5C0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxcl3Q6W5C0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl3Q6W5C0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl3Q6W5C0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl3Q6W5C0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl3Q6W5C0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl3Q6W5C0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl3Q6W5C0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl3Q6W5C0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl3Q6W5C0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl3Q6W5C0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl3Q6W5C0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl3Q6W5C0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl3Q6W5C0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl3Q6W5C0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl3Q6W5C0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl3Q6W5C0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxcl3Q6W5C0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl3Q6W5C0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl3Q6W5C0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl3Q6W5C0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl3Q6W5C0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl3Q6W5C0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl3Q6W5C0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl3Q6W5C0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl3Q6W5C0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl3Q6W5C0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl3Q6W5C0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl3Q6W5C0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl3Q6W5C0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl3Q6W5C0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxcl3Q6W5C0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxcl3Q6W5C0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl3Q6W5C0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl3Q6W5C0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxcl3Q6W5C0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl3Q6W5C0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl3Q6W5C0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl3Q6W5C0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxcl3Q6W5C0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl3Q6W5C0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl3Q6W5C0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl3Q6W5C0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cxcl3Q6W5C0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cxcl3Q6W5C0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl3Q6W5C0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cxcl3Q6W5C0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cxcl3Q6W5C0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxcl3Q6W5C0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxcl3Q6W5C0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cxcl3Q6W5C0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cxcl3Q6W5C0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cxcl3Q6W5C0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cxcl3Q6W5C0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cxcl3Q6W5C0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcl3Q6W5C0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcl3Q6W5C0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cxcl3Q6W5C0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cxcl3Q6W5C0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms