Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc154Q6RUT8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc154Q6RUT8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc154Q6RUT8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc154Q6RUT8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc154Q6RUT8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc154Q6RUT8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc154Q6RUT8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc154Q6RUT8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc154Q6RUT8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc154Q6RUT8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc154Q6RUT8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc154Q6RUT8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc154Q6RUT8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc154Q6RUT8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc154Q6RUT8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc154Q6RUT8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc154Q6RUT8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc154Q6RUT8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc154Q6RUT8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc154Q6RUT8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc154Q6RUT8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc154Q6RUT8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc154Q6RUT8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc154Q6RUT8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc154Q6RUT8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc154Q6RUT8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc154Q6RUT8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc154Q6RUT8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc154Q6RUT8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc154Q6RUT8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc154Q6RUT8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc154Q6RUT8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc154Q6RUT8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc154Q6RUT8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc154Q6RUT8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc154Q6RUT8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc154Q6RUT8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc154Q6RUT8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc154Q6RUT8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc154Q6RUT8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc154Q6RUT8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc154Q6RUT8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc154Q6RUT8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc154Q6RUT8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc154Q6RUT8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc154Q6RUT8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc154Q6RUT8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc154Q6RUT8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc154Q6RUT8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc154Q6RUT8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc154Q6RUT8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc154Q6RUT8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc154Q6RUT8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc154Q6RUT8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc154Q6RUT8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc154Q6RUT8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc154Q6RUT8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc154Q6RUT8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc154Q6RUT8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc154Q6RUT8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms