Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna2d2Q6PHS9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna2d2Q6PHS9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna2d2Q6PHS9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna2d2Q6PHS9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna2d2Q6PHS9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna2d2Q6PHS9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna2d2Q6PHS9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna2d2Q6PHS9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna2d2Q6PHS9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna2d2Q6PHS9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna2d2Q6PHS9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna2d2Q6PHS9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna2d2Q6PHS9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna2d2Q6PHS9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna2d2Q6PHS9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cacna2d2Q6PHS9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna2d2Q6PHS9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna2d2Q6PHS9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cacna2d2Q6PHS9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna2d2Q6PHS9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna2d2Q6PHS9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna2d2Q6PHS9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna2d2Q6PHS9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cacna2d2Q6PHS9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna2d2Q6PHS9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cacna2d2Q6PHS9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna2d2Q6PHS9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cacna2d2Q6PHS9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cacna2d2Q6PHS9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cacna2d2Q6PHS9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna2d2Q6PHS9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cacna2d2Q6PHS9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna2d2Q6PHS9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cacna2d2Q6PHS9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna2d2Q6PHS9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna2d2Q6PHS9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cacna2d2Q6PHS9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cacna2d2Q6PHS9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cacna2d2Q6PHS9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna2d2Q6PHS9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna2d2Q6PHS9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna2d2Q6PHS9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna2d2Q6PHS9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cacna2d2Q6PHS9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna2d2Q6PHS9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna2d2Q6PHS9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna2d2Q6PHS9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cacna2d2Q6PHS9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cacna2d2Q6PHS9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna2d2Q6PHS9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna2d2Q6PHS9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna2d2Q6PHS9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna2d2Q6PHS9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cacna2d2Q6PHS9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna2d2Q6PHS9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cacna2d2Q6PHS9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cacna2d2Q6PHS9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cacna2d2Q6PHS9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna2d2Q6PHS9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna2d2Q6PHS9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cacna2d2Q6PHS9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna2d2Q6PHS9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna2d2Q6PHS9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna2d2Q6PHS9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna2d2Q6PHS9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cacna2d2Q6PHS9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna2d2Q6PHS9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cacna2d2Q6PHS9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna2d2Q6PHS9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cacna2d2Q6PHS9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna2d2Q6PHS9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna2d2Q6PHS9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cacna2d2Q6PHS9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna2d2Q6PHS9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna2d2Q6PHS9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna2d2Q6PHS9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cacna2d2Q6PHS9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cacna2d2Q6PHS9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna2d2Q6PHS9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cacna2d2Q6PHS9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna2d2Q6PHS9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna2d2Q6PHS9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cacna2d2Q6PHS9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna2d2Q6PHS9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cacna2d2Q6PHS9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna2d2Q6PHS9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cacna2d2Q6PHS9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cacna2d2Q6PHS9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cacna2d2Q6PHS9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cacna2d2Q6PHS9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms