Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGN3

Dclk2, Serine/threonine-protein kinase DCLK2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk2Q6PGN3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dclk2Q6PGN3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Dclk2Q6PGN3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dclk2Q6PGN3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Dclk2Q6PGN3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dclk2Q6PGN3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dclk2Q6PGN3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dclk2Q6PGN3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dclk2Q6PGN3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dclk2Q6PGN3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dclk2Q6PGN3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dclk2Q6PGN3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dclk2Q6PGN3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclk2Q6PGN3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dclk2Q6PGN3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dclk2Q6PGN3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dclk2Q6PGN3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dclk2Q6PGN3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk2Q6PGN3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dclk2Q6PGN3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dclk2Q6PGN3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dclk2Q6PGN3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dclk2Q6PGN3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dclk2Q6PGN3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dclk2Q6PGN3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Dclk2Q6PGN3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dclk2Q6PGN3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk2Q6PGN3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk2Q6PGN3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk2Q6PGN3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dclk2Q6PGN3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dclk2Q6PGN3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dclk2Q6PGN3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dclk2Q6PGN3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dclk2Q6PGN3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk2Q6PGN3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk2Q6PGN3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk2Q6PGN3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk2Q6PGN3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk2Q6PGN3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk2Q6PGN3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dclk2Q6PGN3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclk2Q6PGN3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dclk2Q6PGN3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dclk2Q6PGN3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk2Q6PGN3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dclk2Q6PGN3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Dclk2Q6PGN3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dclk2Q6PGN3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dclk2Q6PGN3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dclk2Q6PGN3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dclk2Q6PGN3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dclk2Q6PGN3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dclk2Q6PGN3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dclk2Q6PGN3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dclk2Q6PGN3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dclk2Q6PGN3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dclk2Q6PGN3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dclk2Q6PGN3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dclk2Q6PGN3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dclk2Q6PGN3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dclk2Q6PGN3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms