Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HjurpQ6PG16 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HjurpQ6PG16 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HjurpQ6PG16 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HjurpQ6PG16 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HjurpQ6PG16 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HjurpQ6PG16 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HjurpQ6PG16 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HjurpQ6PG16 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HjurpQ6PG16 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HjurpQ6PG16 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HjurpQ6PG16 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HjurpQ6PG16 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HjurpQ6PG16 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HjurpQ6PG16 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HjurpQ6PG16 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HjurpQ6PG16 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HjurpQ6PG16 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HjurpQ6PG16 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HjurpQ6PG16 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HjurpQ6PG16 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HjurpQ6PG16 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HjurpQ6PG16 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HjurpQ6PG16 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HjurpQ6PG16 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HjurpQ6PG16 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HjurpQ6PG16 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HjurpQ6PG16 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HjurpQ6PG16 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HjurpQ6PG16 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HjurpQ6PG16 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HjurpQ6PG16 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HjurpQ6PG16 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HjurpQ6PG16 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HjurpQ6PG16 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HjurpQ6PG16 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HjurpQ6PG16 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HjurpQ6PG16 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HjurpQ6PG16 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HjurpQ6PG16 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HjurpQ6PG16 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HjurpQ6PG16 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HjurpQ6PG16 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HjurpQ6PG16 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HjurpQ6PG16 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HjurpQ6PG16 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HjurpQ6PG16 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HjurpQ6PG16 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HjurpQ6PG16 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HjurpQ6PG16 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HjurpQ6PG16 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HjurpQ6PG16 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HjurpQ6PG16 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HjurpQ6PG16 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HjurpQ6PG16 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HjurpQ6PG16 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HjurpQ6PG16 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HjurpQ6PG16 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HjurpQ6PG16 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HjurpQ6PG16 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HjurpQ6PG16 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.9 ms