Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD7

Naif1, Nuclear apoptosis-inducing factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Naif1Q6PFD7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Naif1Q6PFD7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Naif1Q6PFD7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Naif1Q6PFD7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Naif1Q6PFD7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Naif1Q6PFD7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Naif1Q6PFD7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Naif1Q6PFD7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Naif1Q6PFD7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Naif1Q6PFD7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Naif1Q6PFD7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Naif1Q6PFD7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Naif1Q6PFD7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Naif1Q6PFD7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Naif1Q6PFD7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Naif1Q6PFD7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Naif1Q6PFD7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Naif1Q6PFD7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Naif1Q6PFD7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Naif1Q6PFD7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Naif1Q6PFD7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Naif1Q6PFD7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Naif1Q6PFD7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Naif1Q6PFD7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Naif1Q6PFD7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Naif1Q6PFD7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Naif1Q6PFD7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Naif1Q6PFD7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Naif1Q6PFD7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Naif1Q6PFD7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Naif1Q6PFD7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Naif1Q6PFD7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Naif1Q6PFD7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Naif1Q6PFD7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Naif1Q6PFD7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Naif1Q6PFD7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Naif1Q6PFD7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Naif1Q6PFD7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Naif1Q6PFD7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Naif1Q6PFD7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Naif1Q6PFD7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Naif1Q6PFD7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Naif1Q6PFD7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Naif1Q6PFD7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Naif1Q6PFD7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Naif1Q6PFD7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Naif1Q6PFD7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Naif1Q6PFD7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Naif1Q6PFD7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Naif1Q6PFD7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Naif1Q6PFD7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Naif1Q6PFD7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Naif1Q6PFD7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Naif1Q6PFD7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Naif1Q6PFD7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Naif1Q6PFD7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Naif1Q6PFD7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Naif1Q6PFD7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Naif1Q6PFD7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Naif1Q6PFD7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Naif1Q6PFD7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Naif1Q6PFD7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Naif1Q6PFD7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms