Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dtx4Q6PDK8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dtx4Q6PDK8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dtx4Q6PDK8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Dtx4Q6PDK8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dtx4Q6PDK8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dtx4Q6PDK8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dtx4Q6PDK8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dtx4Q6PDK8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dtx4Q6PDK8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dtx4Q6PDK8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Dtx4Q6PDK8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dtx4Q6PDK8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dtx4Q6PDK8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dtx4Q6PDK8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dtx4Q6PDK8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dtx4Q6PDK8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dtx4Q6PDK8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dtx4Q6PDK8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dtx4Q6PDK8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dtx4Q6PDK8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dtx4Q6PDK8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dtx4Q6PDK8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dtx4Q6PDK8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dtx4Q6PDK8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dtx4Q6PDK8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dtx4Q6PDK8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dtx4Q6PDK8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Dtx4Q6PDK8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dtx4Q6PDK8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dtx4Q6PDK8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dtx4Q6PDK8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dtx4Q6PDK8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dtx4Q6PDK8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dtx4Q6PDK8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dtx4Q6PDK8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dtx4Q6PDK8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dtx4Q6PDK8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dtx4Q6PDK8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dtx4Q6PDK8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dtx4Q6PDK8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dtx4Q6PDK8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dtx4Q6PDK8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dtx4Q6PDK8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dtx4Q6PDK8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dtx4Q6PDK8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Dtx4Q6PDK8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Dtx4Q6PDK8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dtx4Q6PDK8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms