Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mfsd13aQ6PDE8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mfsd13aQ6PDE8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mfsd13aQ6PDE8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mfsd13aQ6PDE8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mfsd13aQ6PDE8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mfsd13aQ6PDE8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mfsd13aQ6PDE8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mfsd13aQ6PDE8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Mfsd13aQ6PDE8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mfsd13aQ6PDE8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mfsd13aQ6PDE8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mfsd13aQ6PDE8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mfsd13aQ6PDE8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mfsd13aQ6PDE8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mfsd13aQ6PDE8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Mfsd13aQ6PDE8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mfsd13aQ6PDE8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mfsd13aQ6PDE8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mfsd13aQ6PDE8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mfsd13aQ6PDE8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mfsd13aQ6PDE8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd13aQ6PDE8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd13aQ6PDE8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd13aQ6PDE8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mfsd13aQ6PDE8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mfsd13aQ6PDE8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mfsd13aQ6PDE8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mfsd13aQ6PDE8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mfsd13aQ6PDE8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mfsd13aQ6PDE8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mfsd13aQ6PDE8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mfsd13aQ6PDE8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Mfsd13aQ6PDE8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mfsd13aQ6PDE8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mfsd13aQ6PDE8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mfsd13aQ6PDE8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mfsd13aQ6PDE8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd13aQ6PDE8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd13aQ6PDE8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mfsd13aQ6PDE8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd13aQ6PDE8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd13aQ6PDE8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd13aQ6PDE8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mfsd13aQ6PDE8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mfsd13aQ6PDE8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mfsd13aQ6PDE8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mfsd13aQ6PDE8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mfsd13aQ6PDE8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mfsd13aQ6PDE8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd13aQ6PDE8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mfsd13aQ6PDE8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mfsd13aQ6PDE8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mfsd13aQ6PDE8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mfsd13aQ6PDE8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mfsd13aQ6PDE8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mfsd13aQ6PDE8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mfsd13aQ6PDE8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mfsd13aQ6PDE8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mfsd13aQ6PDE8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mfsd13aQ6PDE8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mfsd13aQ6PDE8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mfsd13aQ6PDE8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mfsd13aQ6PDE8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms