Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mfsd4aQ6PDC8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mfsd4aQ6PDC8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mfsd4aQ6PDC8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mfsd4aQ6PDC8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mfsd4aQ6PDC8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mfsd4aQ6PDC8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfsd4aQ6PDC8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfsd4aQ6PDC8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfsd4aQ6PDC8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfsd4aQ6PDC8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mfsd4aQ6PDC8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfsd4aQ6PDC8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfsd4aQ6PDC8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfsd4aQ6PDC8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfsd4aQ6PDC8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfsd4aQ6PDC8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfsd4aQ6PDC8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfsd4aQ6PDC8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfsd4aQ6PDC8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfsd4aQ6PDC8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfsd4aQ6PDC8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfsd4aQ6PDC8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mfsd4aQ6PDC8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mfsd4aQ6PDC8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mfsd4aQ6PDC8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mfsd4aQ6PDC8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfsd4aQ6PDC8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfsd4aQ6PDC8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfsd4aQ6PDC8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfsd4aQ6PDC8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfsd4aQ6PDC8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfsd4aQ6PDC8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfsd4aQ6PDC8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfsd4aQ6PDC8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfsd4aQ6PDC8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfsd4aQ6PDC8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfsd4aQ6PDC8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfsd4aQ6PDC8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfsd4aQ6PDC8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfsd4aQ6PDC8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mfsd4aQ6PDC8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Mfsd4aQ6PDC8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mfsd4aQ6PDC8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mfsd4aQ6PDC8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mfsd4aQ6PDC8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mfsd4aQ6PDC8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mfsd4aQ6PDC8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mfsd4aQ6PDC8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mfsd4aQ6PDC8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mfsd4aQ6PDC8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mfsd4aQ6PDC8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mfsd4aQ6PDC8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mfsd4aQ6PDC8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mfsd4aQ6PDC8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms