Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casc4Q6P2L7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casc4Q6P2L7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casc4Q6P2L7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casc4Q6P2L7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Casc4Q6P2L7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Casc4Q6P2L7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Casc4Q6P2L7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Casc4Q6P2L7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casc4Q6P2L7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Casc4Q6P2L7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Casc4Q6P2L7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Casc4Q6P2L7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Casc4Q6P2L7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Casc4Q6P2L7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casc4Q6P2L7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Casc4Q6P2L7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casc4Q6P2L7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casc4Q6P2L7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casc4Q6P2L7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Casc4Q6P2L7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casc4Q6P2L7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Casc4Q6P2L7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Casc4Q6P2L7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Casc4Q6P2L7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Casc4Q6P2L7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casc4Q6P2L7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Casc4Q6P2L7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casc4Q6P2L7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casc4Q6P2L7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Casc4Q6P2L7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Casc4Q6P2L7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casc4Q6P2L7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casc4Q6P2L7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Casc4Q6P2L7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casc4Q6P2L7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casc4Q6P2L7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casc4Q6P2L7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casc4Q6P2L7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Casc4Q6P2L7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casc4Q6P2L7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casc4Q6P2L7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casc4Q6P2L7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casc4Q6P2L7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casc4Q6P2L7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casc4Q6P2L7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casc4Q6P2L7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casc4Q6P2L7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casc4Q6P2L7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casc4Q6P2L7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casc4Q6P2L7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc4Q6P2L7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc4Q6P2L7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casc4Q6P2L7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms