Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gpbp1l1Q6NZP2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Gpbp1l1Q6NZP2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gpbp1l1Q6NZP2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gpbp1l1Q6NZP2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gpbp1l1Q6NZP2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gpbp1l1Q6NZP2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gpbp1l1Q6NZP2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Gpbp1l1Q6NZP2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gpbp1l1Q6NZP2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gpbp1l1Q6NZP2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gpbp1l1Q6NZP2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gpbp1l1Q6NZP2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Gpbp1l1Q6NZP2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gpbp1l1Q6NZP2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gpbp1l1Q6NZP2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gpbp1l1Q6NZP2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gpbp1l1Q6NZP2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gpbp1l1Q6NZP2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gpbp1l1Q6NZP2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Gpbp1l1Q6NZP2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gpbp1l1Q6NZP2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gpbp1l1Q6NZP2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gpbp1l1Q6NZP2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms