Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sec23ipQ6NZC7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sec23ipQ6NZC7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sec23ipQ6NZC7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sec23ipQ6NZC7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sec23ipQ6NZC7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sec23ipQ6NZC7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sec23ipQ6NZC7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sec23ipQ6NZC7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sec23ipQ6NZC7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sec23ipQ6NZC7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sec23ipQ6NZC7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sec23ipQ6NZC7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sec23ipQ6NZC7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sec23ipQ6NZC7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sec23ipQ6NZC7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Sec23ipQ6NZC7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sec23ipQ6NZC7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sec23ipQ6NZC7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sec23ipQ6NZC7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sec23ipQ6NZC7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sec23ipQ6NZC7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sec23ipQ6NZC7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sec23ipQ6NZC7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sec23ipQ6NZC7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sec23ipQ6NZC7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sec23ipQ6NZC7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sec23ipQ6NZC7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sec23ipQ6NZC7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sec23ipQ6NZC7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sec23ipQ6NZC7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Sec23ipQ6NZC7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sec23ipQ6NZC7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sec23ipQ6NZC7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sec23ipQ6NZC7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sec23ipQ6NZC7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sec23ipQ6NZC7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sec23ipQ6NZC7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sec23ipQ6NZC7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sec23ipQ6NZC7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sec23ipQ6NZC7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sec23ipQ6NZC7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sec23ipQ6NZC7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sec23ipQ6NZC7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sec23ipQ6NZC7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sec23ipQ6NZC7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sec23ipQ6NZC7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sec23ipQ6NZC7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sec23ipQ6NZC7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sec23ipQ6NZC7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sec23ipQ6NZC7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sec23ipQ6NZC7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sec23ipQ6NZC7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sec23ipQ6NZC7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sec23ipQ6NZC7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sec23ipQ6NZC7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sec23ipQ6NZC7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sec23ipQ6NZC7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sec23ipQ6NZC7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sec23ipQ6NZC7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sec23ipQ6NZC7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sec23ipQ6NZC7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sec23ipQ6NZC7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sec23ipQ6NZC7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sec23ipQ6NZC7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sec23ipQ6NZC7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sec23ipQ6NZC7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms