Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
B4galnt3Q6L8S8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
B4galnt3Q6L8S8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
B4galnt3Q6L8S8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
B4galnt3Q6L8S8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms