Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Krt87Q6IMF0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt87Q6IMF0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt87Q6IMF0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt87Q6IMF0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt87Q6IMF0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt87Q6IMF0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt87Q6IMF0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt87Q6IMF0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt87Q6IMF0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt87Q6IMF0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt87Q6IMF0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt87Q6IMF0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt87Q6IMF0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt87Q6IMF0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt87Q6IMF0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt87Q6IMF0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt87Q6IMF0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt87Q6IMF0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt87Q6IMF0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt87Q6IMF0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt87Q6IMF0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt87Q6IMF0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt87Q6IMF0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt87Q6IMF0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Krt87Q6IMF0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krt87Q6IMF0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krt87Q6IMF0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krt87Q6IMF0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt87Q6IMF0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt87Q6IMF0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt87Q6IMF0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt87Q6IMF0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt87Q6IMF0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt87Q6IMF0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Krt87Q6IMF0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Krt87Q6IMF0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt87Q6IMF0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt87Q6IMF0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt87Q6IMF0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt87Q6IMF0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krt87Q6IMF0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krt87Q6IMF0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Krt87Q6IMF0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Krt87Q6IMF0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Krt87Q6IMF0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt87Q6IMF0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krt87Q6IMF0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Krt87Q6IMF0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Krt87Q6IMF0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt87Q6IMF0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt87Q6IMF0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Krt87Q6IMF0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt87Q6IMF0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt87Q6IMF0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt87Q6IMF0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt87Q6IMF0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt87Q6IMF0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Krt87Q6IMF0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krt87Q6IMF0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krt87Q6IMF0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt87Q6IMF0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt87Q6IMF0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt87Q6IMF0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt87Q6IMF0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt87Q6IMF0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt87Q6IMF0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt87Q6IMF0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt87Q6IMF0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt87Q6IMF0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt87Q6IMF0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt87Q6IMF0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt87Q6IMF0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt87Q6IMF0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt87Q6IMF0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt87Q6IMF0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt87Q6IMF0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt87Q6IMF0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt87Q6IMF0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt87Q6IMF0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt87Q6IMF0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt87Q6IMF0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms