Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Best3Q6H1V1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Best3Q6H1V1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Best3Q6H1V1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Best3Q6H1V1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Best3Q6H1V1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Best3Q6H1V1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Best3Q6H1V1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Best3Q6H1V1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Best3Q6H1V1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Best3Q6H1V1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Best3Q6H1V1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Best3Q6H1V1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Best3Q6H1V1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Best3Q6H1V1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Best3Q6H1V1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Best3Q6H1V1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Best3Q6H1V1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Best3Q6H1V1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Best3Q6H1V1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Best3Q6H1V1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Best3Q6H1V1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Best3Q6H1V1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Best3Q6H1V1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Best3Q6H1V1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Best3Q6H1V1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Best3Q6H1V1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Best3Q6H1V1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Best3Q6H1V1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Best3Q6H1V1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Best3Q6H1V1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Best3Q6H1V1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Best3Q6H1V1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Best3Q6H1V1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Best3Q6H1V1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Best3Q6H1V1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Best3Q6H1V1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Best3Q6H1V1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Best3Q6H1V1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Best3Q6H1V1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Best3Q6H1V1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Best3Q6H1V1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Best3Q6H1V1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Best3Q6H1V1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Best3Q6H1V1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Best3Q6H1V1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Best3Q6H1V1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Best3Q6H1V1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Best3Q6H1V1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Best3Q6H1V1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Best3Q6H1V1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Best3Q6H1V1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Best3Q6H1V1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Best3Q6H1V1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Best3Q6H1V1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Best3Q6H1V1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Best3Q6H1V1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Best3Q6H1V1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Best3Q6H1V1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Best3Q6H1V1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Best3Q6H1V1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Best3Q6H1V1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Best3Q6H1V1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Best3Q6H1V1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Best3Q6H1V1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Best3Q6H1V1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Best3Q6H1V1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Best3Q6H1V1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Best3Q6H1V1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Best3Q6H1V1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Best3Q6H1V1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Best3Q6H1V1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Best3Q6H1V1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Best3Q6H1V1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Best3Q6H1V1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Best3Q6H1V1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Best3Q6H1V1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Best3Q6H1V1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Best3Q6H1V1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Best3Q6H1V1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Best3Q6H1V1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Best3Q6H1V1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms