Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nckap5lQ6GQX2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nckap5lQ6GQX2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nckap5lQ6GQX2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nckap5lQ6GQX2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nckap5lQ6GQX2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nckap5lQ6GQX2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nckap5lQ6GQX2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Nckap5lQ6GQX2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Nckap5lQ6GQX2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nckap5lQ6GQX2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Nckap5lQ6GQX2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Nckap5lQ6GQX2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nckap5lQ6GQX2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nckap5lQ6GQX2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nckap5lQ6GQX2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nckap5lQ6GQX2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nckap5lQ6GQX2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nckap5lQ6GQX2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nckap5lQ6GQX2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Nckap5lQ6GQX2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Nckap5lQ6GQX2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Nckap5lQ6GQX2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Nckap5lQ6GQX2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nckap5lQ6GQX2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nckap5lQ6GQX2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nckap5lQ6GQX2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nckap5lQ6GQX2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nckap5lQ6GQX2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nckap5lQ6GQX2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nckap5lQ6GQX2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nckap5lQ6GQX2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nckap5lQ6GQX2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nckap5lQ6GQX2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Nckap5lQ6GQX2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nckap5lQ6GQX2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Nckap5lQ6GQX2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nckap5lQ6GQX2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nckap5lQ6GQX2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nckap5lQ6GQX2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nckap5lQ6GQX2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nckap5lQ6GQX2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nckap5lQ6GQX2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nckap5lQ6GQX2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nckap5lQ6GQX2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nckap5lQ6GQX2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Nckap5lQ6GQX2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nckap5lQ6GQX2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nckap5lQ6GQX2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nckap5lQ6GQX2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nckap5lQ6GQX2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nckap5lQ6GQX2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nckap5lQ6GQX2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nckap5lQ6GQX2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nckap5lQ6GQX2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Nckap5lQ6GQX2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nckap5lQ6GQX2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Nckap5lQ6GQX2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nckap5lQ6GQX2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nckap5lQ6GQX2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nckap5lQ6GQX2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nckap5lQ6GQX2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nckap5lQ6GQX2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nckap5lQ6GQX2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nckap5lQ6GQX2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nckap5lQ6GQX2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Nckap5lQ6GQX2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Nckap5lQ6GQX2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Nckap5lQ6GQX2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nckap5lQ6GQX2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nckap5lQ6GQX2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Nckap5lQ6GQX2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nckap5lQ6GQX2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nckap5lQ6GQX2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nckap5lQ6GQX2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nckap5lQ6GQX2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nckap5lQ6GQX2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nckap5lQ6GQX2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nckap5lQ6GQX2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Nckap5lQ6GQX2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nckap5lQ6GQX2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nckap5lQ6GQX2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nckap5lQ6GQX2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nckap5lQ6GQX2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nckap5lQ6GQX2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nckap5lQ6GQX2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nckap5lQ6GQX2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nckap5lQ6GQX2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Nckap5lQ6GQX2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Nckap5lQ6GQX2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Nckap5lQ6GQX2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nckap5lQ6GQX2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Nckap5lQ6GQX2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nckap5lQ6GQX2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nckap5lQ6GQX2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Nckap5lQ6GQX2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Nckap5lQ6GQX2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Nckap5lQ6GQX2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms