Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ddx11Q6AXC6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ddx11Q6AXC6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ddx11Q6AXC6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ddx11Q6AXC6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ddx11Q6AXC6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ddx11Q6AXC6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ddx11Q6AXC6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ddx11Q6AXC6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ddx11Q6AXC6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ddx11Q6AXC6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ddx11Q6AXC6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ddx11Q6AXC6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ddx11Q6AXC6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ddx11Q6AXC6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ddx11Q6AXC6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ddx11Q6AXC6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ddx11Q6AXC6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ddx11Q6AXC6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ddx11Q6AXC6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ddx11Q6AXC6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ddx11Q6AXC6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ddx11Q6AXC6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ddx11Q6AXC6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ddx11Q6AXC6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ddx11Q6AXC6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ddx11Q6AXC6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ddx11Q6AXC6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ddx11Q6AXC6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ddx11Q6AXC6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ddx11Q6AXC6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ddx11Q6AXC6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ddx11Q6AXC6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ddx11Q6AXC6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ddx11Q6AXC6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ddx11Q6AXC6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ddx11Q6AXC6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ddx11Q6AXC6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ddx11Q6AXC6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ddx11Q6AXC6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ddx11Q6AXC6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ddx11Q6AXC6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ddx11Q6AXC6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ddx11Q6AXC6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ddx11Q6AXC6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ddx11Q6AXC6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ddx11Q6AXC6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ddx11Q6AXC6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ddx11Q6AXC6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ddx11Q6AXC6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ddx11Q6AXC6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ddx11Q6AXC6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ddx11Q6AXC6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ddx11Q6AXC6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ddx11Q6AXC6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ddx11Q6AXC6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ddx11Q6AXC6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ddx11Q6AXC6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ddx11Q6AXC6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ddx11Q6AXC6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ddx11Q6AXC6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ddx11Q6AXC6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ddx11Q6AXC6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ddx11Q6AXC6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ddx11Q6AXC6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ddx11Q6AXC6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ddx11Q6AXC6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ddx11Q6AXC6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ddx11Q6AXC6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ddx11Q6AXC6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ddx11Q6AXC6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ddx11Q6AXC6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ddx11Q6AXC6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ddx11Q6AXC6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ddx11Q6AXC6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ddx11Q6AXC6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ddx11Q6AXC6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ddx11Q6AXC6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ddx11Q6AXC6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ddx11Q6AXC6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ddx11Q6AXC6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ddx11Q6AXC6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms