Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp7Q6A4J8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp7Q6A4J8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp7Q6A4J8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp7Q6A4J8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp7Q6A4J8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp7Q6A4J8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp7Q6A4J8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp7Q6A4J8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp7Q6A4J8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp7Q6A4J8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp7Q6A4J8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp7Q6A4J8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp7Q6A4J8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp7Q6A4J8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp7Q6A4J8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp7Q6A4J8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp7Q6A4J8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp7Q6A4J8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp7Q6A4J8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp7Q6A4J8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp7Q6A4J8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp7Q6A4J8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp7Q6A4J8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp7Q6A4J8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp7Q6A4J8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp7Q6A4J8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp7Q6A4J8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp7Q6A4J8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp7Q6A4J8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp7Q6A4J8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp7Q6A4J8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp7Q6A4J8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp7Q6A4J8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp7Q6A4J8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp7Q6A4J8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp7Q6A4J8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp7Q6A4J8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp7Q6A4J8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp7Q6A4J8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp7Q6A4J8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp7Q6A4J8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp7Q6A4J8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp7Q6A4J8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp7Q6A4J8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp7Q6A4J8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp7Q6A4J8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.5 ms