Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Cep170Q6A065 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Cep170Q6A065 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Cep170Q6A065 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Cep170Q6A065 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Cep170Q6A065 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Cep170Q6A065 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Cep170Q6A065 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Cep170Q6A065 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Cep170Q6A065 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
Cep170Q6A065 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Cep170Q6A065 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Cep170Q6A065 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Cep170Q6A065 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Cep170Q6A065 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
Cep170Q6A065 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Cep170Q6A065 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Cep170Q6A065 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Cep170Q6A065 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Cep170Q6A065 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Cep170Q6A065 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Cep170Q6A065 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Cep170Q6A065 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Cep170Q6A065 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Cep170Q6A065 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Cep170Q6A065 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
Cep170Q6A065 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Cep170Q6A065 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Cep170Q6A065 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Cep170Q6A065 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Cep170Q6A065 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Cep170Q6A065 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Cep170Q6A065 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Cep170Q6A065 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Cep170Q6A065 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Cep170Q6A065 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
Cep170Q6A065 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Cep170Q6A065 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Cep170Q6A065 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Cep170Q6A065 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Cep170Q6A065 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Cep170Q6A065 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Cep170Q6A065 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Cep170Q6A065 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Cep170Q6A065 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Cep170Q6A065 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Cep170Q6A065 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Cep170Q6A065 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Cep170Q6A065 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Cep170Q6A065 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Cep170Q6A065 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Cep170Q6A065 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Cep170Q6A065 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Cep170Q6A065 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Cep170Q6A065 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Cep170Q6A065 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Cep170Q6A065 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Cep170Q6A065 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Cep170Q6A065 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Cep170Q6A065 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Cep170Q6A065 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Cep170Q6A065 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
Cep170Q6A065 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Cep170Q6A065 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Cep170Q6A065 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Cep170Q6A065 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Cep170Q6A065 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cep170Q6A065 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Cep170Q6A065 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Cep170Q6A065 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Cep170Q6A065 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Cep170Q6A065 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Cep170Q6A065 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Cep170Q6A065 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Cep170Q6A065 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Cep170Q6A065 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Cep170Q6A065 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Cep170Q6A065 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Cep170Q6A065 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Cep170Q6A065 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
Cep170Q6A065 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Cep170Q6A065 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Cep170Q6A065 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Cep170Q6A065 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Cep170Q6A065 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Cep170Q6A065 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Cep170Q6A065 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Cep170Q6A065 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cep170Q6A065 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cep170Q6A065 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cep170Q6A065 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Cep170Q6A065 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cep170Q6A065 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
Cep170Q6A065 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cep170Q6A065 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Cep170Q6A065 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
Cep170Q6A065 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
Cep170Q6A065 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Cep170Q6A065 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Cep170Q6A065 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms