Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn3Q64691 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn3Q64691 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn3Q64691 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn3Q64691 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn3Q64691 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Capn3Q64691 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Capn3Q64691 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Capn3Q64691 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn3Q64691 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn3Q64691 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn3Q64691 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn3Q64691 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn3Q64691 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn3Q64691 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn3Q64691 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn3Q64691 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn3Q64691 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn3Q64691 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn3Q64691 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn3Q64691 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn3Q64691 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn3Q64691 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn3Q64691 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn3Q64691 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn3Q64691 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn3Q64691 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn3Q64691 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn3Q64691 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn3Q64691 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn3Q64691 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn3Q64691 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn3Q64691 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn3Q64691 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn3Q64691 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn3Q64691 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn3Q64691 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn3Q64691 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn3Q64691 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn3Q64691 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Capn3Q64691 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Capn3Q64691 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capn3Q64691 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Capn3Q64691 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Capn3Q64691 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn3Q64691 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn3Q64691 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Capn3Q64691 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Capn3Q64691 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn3Q64691 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Capn3Q64691 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn3Q64691 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn3Q64691 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn3Q64691 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn3Q64691 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Capn3Q64691 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms