Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtprdQ64487 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprdQ64487 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprdQ64487 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprdQ64487 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprdQ64487 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtprdQ64487 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprdQ64487 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtprdQ64487 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtprdQ64487 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtprdQ64487 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtprdQ64487 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprdQ64487 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprdQ64487 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PtprdQ64487 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprdQ64487 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprdQ64487 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprdQ64487 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtprdQ64487 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprdQ64487 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtprdQ64487 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprdQ64487 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprdQ64487 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PtprdQ64487 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprdQ64487 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprdQ64487 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtprdQ64487 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PtprdQ64487 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtprdQ64487 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprdQ64487 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprdQ64487 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtprdQ64487 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtprdQ64487 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprdQ64487 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprdQ64487 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprdQ64487 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprdQ64487 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtprdQ64487 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprdQ64487 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprdQ64487 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtprdQ64487 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprdQ64487 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtprdQ64487 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtprdQ64487 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprdQ64487 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprdQ64487 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprdQ64487 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtprdQ64487 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtprdQ64487 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprdQ64487 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprdQ64487 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprdQ64487 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtprdQ64487 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprdQ64487 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprdQ64487 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtprdQ64487 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprdQ64487 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PtprdQ64487 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtprdQ64487 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtprdQ64487 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtprdQ64487 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprdQ64487 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprdQ64487 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprdQ64487 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtprdQ64487 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprdQ64487 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtprdQ64487 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprdQ64487 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprdQ64487 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtprdQ64487 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprdQ64487 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PtprdQ64487 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprdQ64487 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtprdQ64487 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtprdQ64487 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PtprdQ64487 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtprdQ64487 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprdQ64487 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtprdQ64487 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprdQ64487 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprdQ64487 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtprdQ64487 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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