Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sprr1bQ62267 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sprr1bQ62267 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sprr1bQ62267 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sprr1bQ62267 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sprr1bQ62267 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms