Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Six1Q62231 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Six1Q62231 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Six1Q62231 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Six1Q62231 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Six1Q62231 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Six1Q62231 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Six1Q62231 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Six1Q62231 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Six1Q62231 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Six1Q62231 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Six1Q62231 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Six1Q62231 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Six1Q62231 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Six1Q62231 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Six1Q62231 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Six1Q62231 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Six1Q62231 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Six1Q62231 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Six1Q62231 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Six1Q62231 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Six1Q62231 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Six1Q62231 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Six1Q62231 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Six1Q62231 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Six1Q62231 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Six1Q62231 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Six1Q62231 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Six1Q62231 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Six1Q62231 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Six1Q62231 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Six1Q62231 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Six1Q62231 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Six1Q62231 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Six1Q62231 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Six1Q62231 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Six1Q62231 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Six1Q62231 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Six1Q62231 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Six1Q62231 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Six1Q62231 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Six1Q62231 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Six1Q62231 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Six1Q62231 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Six1Q62231 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Six1Q62231 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Six1Q62231 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Six1Q62231 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Six1Q62231 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Six1Q62231 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Six1Q62231 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Six1Q62231 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Six1Q62231 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Six1Q62231 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Six1Q62231 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Six1Q62231 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Six1Q62231 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Six1Q62231 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Six1Q62231 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Six1Q62231 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Six1Q62231 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Six1Q62231 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Six1Q62231 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Six1Q62231 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Six1Q62231 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Six1Q62231 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Six1Q62231 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Six1Q62231 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Six1Q62231 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Six1Q62231 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Six1Q62231 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Six1Q62231 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Six1Q62231 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Six1Q62231 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Six1Q62231 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Six1Q62231 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Six1Q62231 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Six1Q62231 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Six1Q62231 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Six1Q62231 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Six1Q62231 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Six1Q62231 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Six1Q62231 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Six1Q62231 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Six1Q62231 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Six1Q62231 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Six1Q62231 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Six1Q62231 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Six1Q62231 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Six1Q62231 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Six1Q62231 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Six1Q62231 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Six1Q62231 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six1Q62231 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Six1Q62231 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms