Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprrQ62132 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprrQ62132 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprrQ62132 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprrQ62132 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprrQ62132 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprrQ62132 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprrQ62132 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprrQ62132 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprrQ62132 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprrQ62132 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprrQ62132 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PtprrQ62132 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprrQ62132 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprrQ62132 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprrQ62132 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprrQ62132 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprrQ62132 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprrQ62132 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprrQ62132 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprrQ62132 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprrQ62132 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprrQ62132 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprrQ62132 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprrQ62132 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprrQ62132 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprrQ62132 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprrQ62132 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprrQ62132 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprrQ62132 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprrQ62132 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprrQ62132 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprrQ62132 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprrQ62132 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprrQ62132 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms