Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E2f1Q61501 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E2f1Q61501 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2f1Q61501 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
E2f1Q61501 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E2f1Q61501 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E2f1Q61501 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2f1Q61501 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2f1Q61501 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E2f1Q61501 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
E2f1Q61501 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2f1Q61501 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2f1Q61501 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E2f1Q61501 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2f1Q61501 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
E2f1Q61501 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2f1Q61501 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2f1Q61501 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2f1Q61501 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2f1Q61501 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2f1Q61501 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2f1Q61501 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2f1Q61501 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2f1Q61501 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2f1Q61501 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2f1Q61501 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2f1Q61501 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2f1Q61501 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2f1Q61501 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2f1Q61501 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2f1Q61501 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2f1Q61501 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2f1Q61501 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2f1Q61501 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2f1Q61501 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
E2f1Q61501 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2f1Q61501 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
E2f1Q61501 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2f1Q61501 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2f1Q61501 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2f1Q61501 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2f1Q61501 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2f1Q61501 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2f1Q61501 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2f1Q61501 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2f1Q61501 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2f1Q61501 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2f1Q61501 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2f1Q61501 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2f1Q61501 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2f1Q61501 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
E2f1Q61501 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2f1Q61501 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2f1Q61501 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2f1Q61501 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2f1Q61501 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2f1Q61501 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2f1Q61501 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2f1Q61501 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E2f1Q61501 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2f1Q61501 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E2f1Q61501 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2f1Q61501 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2f1Q61501 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2f1Q61501 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2f1Q61501 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E2f1Q61501 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2f1Q61501 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2f1Q61501 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2f1Q61501 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2f1Q61501 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
E2f1Q61501 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2f1Q61501 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E2f1Q61501 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2f1Q61501 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2f1Q61501 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E2f1Q61501 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2f1Q61501 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2f1Q61501 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E2f1Q61501 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
E2f1Q61501 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms