Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lcp1Q61233 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lcp1Q61233 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lcp1Q61233 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lcp1Q61233 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lcp1Q61233 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lcp1Q61233 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lcp1Q61233 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lcp1Q61233 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lcp1Q61233 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lcp1Q61233 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lcp1Q61233 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lcp1Q61233 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lcp1Q61233 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lcp1Q61233 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lcp1Q61233 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lcp1Q61233 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lcp1Q61233 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lcp1Q61233 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lcp1Q61233 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lcp1Q61233 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lcp1Q61233 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lcp1Q61233 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lcp1Q61233 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lcp1Q61233 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lcp1Q61233 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lcp1Q61233 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lcp1Q61233 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lcp1Q61233 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lcp1Q61233 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lcp1Q61233 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lcp1Q61233 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lcp1Q61233 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lcp1Q61233 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lcp1Q61233 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lcp1Q61233 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lcp1Q61233 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lcp1Q61233 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lcp1Q61233 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lcp1Q61233 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lcp1Q61233 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms