Protein–RNA interactions for Protein: Q60990

Rbmy1b, RNA-binding motif protein, Y chromosome, family 1 member B, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbmy1bQ60990 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbmy1bQ60990 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbmy1bQ60990 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbmy1bQ60990 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbmy1bQ60990 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbmy1bQ60990 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbmy1bQ60990 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbmy1bQ60990 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rbmy1bQ60990 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbmy1bQ60990 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbmy1bQ60990 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbmy1bQ60990 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbmy1bQ60990 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbmy1bQ60990 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbmy1bQ60990 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rbmy1bQ60990 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbmy1bQ60990 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rbmy1bQ60990 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbmy1bQ60990 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms