Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf3Q60980 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klf3Q60980 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf3Q60980 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf3Q60980 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf3Q60980 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf3Q60980 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf3Q60980 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klf3Q60980 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf3Q60980 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf3Q60980 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf3Q60980 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Klf3Q60980 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klf3Q60980 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Klf3Q60980 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Klf3Q60980 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf3Q60980 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Klf3Q60980 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klf3Q60980 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klf3Q60980 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klf3Q60980 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf3Q60980 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klf3Q60980 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klf3Q60980 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klf3Q60980 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf3Q60980 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf3Q60980 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf3Q60980 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf3Q60980 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klf3Q60980 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klf3Q60980 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klf3Q60980 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klf3Q60980 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf3Q60980 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf3Q60980 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Klf3Q60980 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Klf3Q60980 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Klf3Q60980 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klf3Q60980 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms