Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
JrkQ60976 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
JrkQ60976 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
JrkQ60976 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
JrkQ60976 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
JrkQ60976 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
JrkQ60976 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
JrkQ60976 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
JrkQ60976 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
JrkQ60976 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
JrkQ60976 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
JrkQ60976 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
JrkQ60976 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
JrkQ60976 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
JrkQ60976 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
JrkQ60976 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
JrkQ60976 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
JrkQ60976 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
JrkQ60976 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
JrkQ60976 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
JrkQ60976 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
JrkQ60976 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
JrkQ60976 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
JrkQ60976 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
JrkQ60976 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
JrkQ60976 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
JrkQ60976 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
JrkQ60976 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
JrkQ60976 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
JrkQ60976 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
JrkQ60976 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
JrkQ60976 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
JrkQ60976 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JrkQ60976 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
JrkQ60976 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
JrkQ60976 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
JrkQ60976 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
JrkQ60976 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
JrkQ60976 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
JrkQ60976 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
JrkQ60976 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
JrkQ60976 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
JrkQ60976 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
JrkQ60976 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
JrkQ60976 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
JrkQ60976 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
JrkQ60976 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JrkQ60976 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
JrkQ60976 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
JrkQ60976 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
JrkQ60976 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
JrkQ60976 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
JrkQ60976 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
JrkQ60976 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
JrkQ60976 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
JrkQ60976 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
JrkQ60976 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
JrkQ60976 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
JrkQ60976 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
JrkQ60976 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
JrkQ60976 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
JrkQ60976 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
JrkQ60976 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
JrkQ60976 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
JrkQ60976 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
JrkQ60976 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
JrkQ60976 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
JrkQ60976 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
JrkQ60976 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
JrkQ60976 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
JrkQ60976 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
JrkQ60976 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
JrkQ60976 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JrkQ60976 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JrkQ60976 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JrkQ60976 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JrkQ60976 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JrkQ60976 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JrkQ60976 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms