Protein–RNA interactions for Protein: Q60754

Marco, Macrophage receptor MARCO, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MarcoQ60754 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MarcoQ60754 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MarcoQ60754 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MarcoQ60754 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MarcoQ60754 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MarcoQ60754 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MarcoQ60754 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MarcoQ60754 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MarcoQ60754 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MarcoQ60754 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MarcoQ60754 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MarcoQ60754 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MarcoQ60754 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MarcoQ60754 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MarcoQ60754 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MarcoQ60754 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MarcoQ60754 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MarcoQ60754 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MarcoQ60754 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MarcoQ60754 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MarcoQ60754 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MarcoQ60754 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MarcoQ60754 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MarcoQ60754 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MarcoQ60754 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MarcoQ60754 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MarcoQ60754 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MarcoQ60754 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MarcoQ60754 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MarcoQ60754 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MarcoQ60754 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MarcoQ60754 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MarcoQ60754 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MarcoQ60754 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MarcoQ60754 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MarcoQ60754 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MarcoQ60754 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MarcoQ60754 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MarcoQ60754 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MarcoQ60754 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MarcoQ60754 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MarcoQ60754 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MarcoQ60754 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MarcoQ60754 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MarcoQ60754 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MarcoQ60754 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MarcoQ60754 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MarcoQ60754 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MarcoQ60754 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MarcoQ60754 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MarcoQ60754 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MarcoQ60754 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MarcoQ60754 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MarcoQ60754 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MarcoQ60754 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MarcoQ60754 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MarcoQ60754 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MarcoQ60754 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MarcoQ60754 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MarcoQ60754 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MarcoQ60754 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms