Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CttnQ60598 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CttnQ60598 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CttnQ60598 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CttnQ60598 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CttnQ60598 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CttnQ60598 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CttnQ60598 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CttnQ60598 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CttnQ60598 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CttnQ60598 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CttnQ60598 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CttnQ60598 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CttnQ60598 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CttnQ60598 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CttnQ60598 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CttnQ60598 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CttnQ60598 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CttnQ60598 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CttnQ60598 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CttnQ60598 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CttnQ60598 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CttnQ60598 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CttnQ60598 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CttnQ60598 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CttnQ60598 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CttnQ60598 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CttnQ60598 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CttnQ60598 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CttnQ60598 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CttnQ60598 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CttnQ60598 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CttnQ60598 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CttnQ60598 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CttnQ60598 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CttnQ60598 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CttnQ60598 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CttnQ60598 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CttnQ60598 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CttnQ60598 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CttnQ60598 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CttnQ60598 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CttnQ60598 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CttnQ60598 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CttnQ60598 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CttnQ60598 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CttnQ60598 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CttnQ60598 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CttnQ60598 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CttnQ60598 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CttnQ60598 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CttnQ60598 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CttnQ60598 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CttnQ60598 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CttnQ60598 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CttnQ60598 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CttnQ60598 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CttnQ60598 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CttnQ60598 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CttnQ60598 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CttnQ60598 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CttnQ60598 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CttnQ60598 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CttnQ60598 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CttnQ60598 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CttnQ60598 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CttnQ60598 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CttnQ60598 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CttnQ60598 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CttnQ60598 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CttnQ60598 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CttnQ60598 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CttnQ60598 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CttnQ60598 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CttnQ60598 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CttnQ60598 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CttnQ60598 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CttnQ60598 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CttnQ60598 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CttnQ60598 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CttnQ60598 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CttnQ60598 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CttnQ60598 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CttnQ60598 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CttnQ60598 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CttnQ60598 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CttnQ60598 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CttnQ60598 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CttnQ60598 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CttnQ60598 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CttnQ60598 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CttnQ60598 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CttnQ60598 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CttnQ60598 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CttnQ60598 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CttnQ60598 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CttnQ60598 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CttnQ60598 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CttnQ60598 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CttnQ60598 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms