Protein–RNA interactions for Protein: Q5YD48

A1cf, APOBEC1 complementation factor, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1cfQ5YD48 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A1cfQ5YD48 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
A1cfQ5YD48 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
A1cfQ5YD48 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A1cfQ5YD48 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
A1cfQ5YD48 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A1cfQ5YD48 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A1cfQ5YD48 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
A1cfQ5YD48 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A1cfQ5YD48 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A1cfQ5YD48 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A1cfQ5YD48 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
A1cfQ5YD48 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A1cfQ5YD48 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
A1cfQ5YD48 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A1cfQ5YD48 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
A1cfQ5YD48 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A1cfQ5YD48 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
A1cfQ5YD48 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A1cfQ5YD48 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A1cfQ5YD48 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A1cfQ5YD48 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A1cfQ5YD48 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A1cfQ5YD48 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A1cfQ5YD48 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
A1cfQ5YD48 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A1cfQ5YD48 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A1cfQ5YD48 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A1cfQ5YD48 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A1cfQ5YD48 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A1cfQ5YD48 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A1cfQ5YD48 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A1cfQ5YD48 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A1cfQ5YD48 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A1cfQ5YD48 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A1cfQ5YD48 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A1cfQ5YD48 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A1cfQ5YD48 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A1cfQ5YD48 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A1cfQ5YD48 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
A1cfQ5YD48 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A1cfQ5YD48 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A1cfQ5YD48 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A1cfQ5YD48 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A1cfQ5YD48 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A1cfQ5YD48 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
A1cfQ5YD48 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A1cfQ5YD48 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A1cfQ5YD48 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A1cfQ5YD48 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A1cfQ5YD48 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A1cfQ5YD48 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A1cfQ5YD48 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A1cfQ5YD48 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
A1cfQ5YD48 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A1cfQ5YD48 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A1cfQ5YD48 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A1cfQ5YD48 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A1cfQ5YD48 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A1cfQ5YD48 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A1cfQ5YD48 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A1cfQ5YD48 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A1cfQ5YD48 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
A1cfQ5YD48 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A1cfQ5YD48 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A1cfQ5YD48 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A1cfQ5YD48 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A1cfQ5YD48 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A1cfQ5YD48 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A1cfQ5YD48 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A1cfQ5YD48 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A1cfQ5YD48 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A1cfQ5YD48 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A1cfQ5YD48 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A1cfQ5YD48 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
A1cfQ5YD48 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
A1cfQ5YD48 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A1cfQ5YD48 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A1cfQ5YD48 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A1cfQ5YD48 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A1cfQ5YD48 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A1cfQ5YD48 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A1cfQ5YD48 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
A1cfQ5YD48 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A1cfQ5YD48 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
A1cfQ5YD48 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A1cfQ5YD48 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A1cfQ5YD48 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A1cfQ5YD48 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
A1cfQ5YD48 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
A1cfQ5YD48 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A1cfQ5YD48 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A1cfQ5YD48 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
A1cfQ5YD48 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A1cfQ5YD48 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
A1cfQ5YD48 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
A1cfQ5YD48 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
A1cfQ5YD48 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A1cfQ5YD48 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
A1cfQ5YD48 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms