Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arhgap44Q5SSM3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Arhgap44Q5SSM3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arhgap44Q5SSM3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arhgap44Q5SSM3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Arhgap44Q5SSM3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Arhgap44Q5SSM3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms