Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQX6

Cyfip2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip2Q5SQX6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyfip2Q5SQX6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyfip2Q5SQX6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyfip2Q5SQX6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cyfip2Q5SQX6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyfip2Q5SQX6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cyfip2Q5SQX6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cyfip2Q5SQX6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cyfip2Q5SQX6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cyfip2Q5SQX6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cyfip2Q5SQX6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cyfip2Q5SQX6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyfip2Q5SQX6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyfip2Q5SQX6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyfip2Q5SQX6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyfip2Q5SQX6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cyfip2Q5SQX6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cyfip2Q5SQX6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cyfip2Q5SQX6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyfip2Q5SQX6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyfip2Q5SQX6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyfip2Q5SQX6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cyfip2Q5SQX6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cyfip2Q5SQX6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cyfip2Q5SQX6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyfip2Q5SQX6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cyfip2Q5SQX6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyfip2Q5SQX6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyfip2Q5SQX6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyfip2Q5SQX6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cyfip2Q5SQX6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyfip2Q5SQX6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyfip2Q5SQX6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyfip2Q5SQX6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyfip2Q5SQX6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyfip2Q5SQX6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyfip2Q5SQX6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyfip2Q5SQX6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyfip2Q5SQX6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyfip2Q5SQX6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyfip2Q5SQX6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyfip2Q5SQX6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyfip2Q5SQX6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyfip2Q5SQX6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyfip2Q5SQX6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyfip2Q5SQX6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyfip2Q5SQX6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cyfip2Q5SQX6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyfip2Q5SQX6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyfip2Q5SQX6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyfip2Q5SQX6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyfip2Q5SQX6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyfip2Q5SQX6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyfip2Q5SQX6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyfip2Q5SQX6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyfip2Q5SQX6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyfip2Q5SQX6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyfip2Q5SQX6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyfip2Q5SQX6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyfip2Q5SQX6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyfip2Q5SQX6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyfip2Q5SQX6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyfip2Q5SQX6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyfip2Q5SQX6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyfip2Q5SQX6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyfip2Q5SQX6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyfip2Q5SQX6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyfip2Q5SQX6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyfip2Q5SQX6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyfip2Q5SQX6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyfip2Q5SQX6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyfip2Q5SQX6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyfip2Q5SQX6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyfip2Q5SQX6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyfip2Q5SQX6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyfip2Q5SQX6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyfip2Q5SQX6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyfip2Q5SQX6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyfip2Q5SQX6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyfip2Q5SQX6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyfip2Q5SQX6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyfip2Q5SQX6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyfip2Q5SQX6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyfip2Q5SQX6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyfip2Q5SQX6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyfip2Q5SQX6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyfip2Q5SQX6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyfip2Q5SQX6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyfip2Q5SQX6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyfip2Q5SQX6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyfip2Q5SQX6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms