Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5431Q5NCB3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5431Q5NCB3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5431Q5NCB3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5431Q5NCB3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm5431Q5NCB3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5431Q5NCB3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5431Q5NCB3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm5431Q5NCB3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5431Q5NCB3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5431Q5NCB3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5431Q5NCB3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5431Q5NCB3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5431Q5NCB3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5431Q5NCB3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5431Q5NCB3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5431Q5NCB3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5431Q5NCB3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5431Q5NCB3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5431Q5NCB3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5431Q5NCB3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5431Q5NCB3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5431Q5NCB3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5431Q5NCB3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5431Q5NCB3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5431Q5NCB3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5431Q5NCB3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5431Q5NCB3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5431Q5NCB3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5431Q5NCB3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5431Q5NCB3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5431Q5NCB3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5431Q5NCB3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5431Q5NCB3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5431Q5NCB3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5431Q5NCB3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5431Q5NCB3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5431Q5NCB3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm5431Q5NCB3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5431Q5NCB3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5431Q5NCB3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5431Q5NCB3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5431Q5NCB3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5431Q5NCB3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5431Q5NCB3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5431Q5NCB3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5431Q5NCB3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5431Q5NCB3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5431Q5NCB3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5431Q5NCB3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5431Q5NCB3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5431Q5NCB3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5431Q5NCB3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5431Q5NCB3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5431Q5NCB3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5431Q5NCB3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5431Q5NCB3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms