Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hs3st6Q5GFD5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hs3st6Q5GFD5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hs3st6Q5GFD5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hs3st6Q5GFD5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hs3st6Q5GFD5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hs3st6Q5GFD5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hs3st6Q5GFD5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hs3st6Q5GFD5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hs3st6Q5GFD5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hs3st6Q5GFD5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hs3st6Q5GFD5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Hs3st6Q5GFD5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hs3st6Q5GFD5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hs3st6Q5GFD5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hs3st6Q5GFD5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hs3st6Q5GFD5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hs3st6Q5GFD5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hs3st6Q5GFD5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hs3st6Q5GFD5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hs3st6Q5GFD5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hs3st6Q5GFD5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hs3st6Q5GFD5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hs3st6Q5GFD5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hs3st6Q5GFD5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hs3st6Q5GFD5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hs3st6Q5GFD5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hs3st6Q5GFD5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hs3st6Q5GFD5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hs3st6Q5GFD5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hs3st6Q5GFD5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hs3st6Q5GFD5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hs3st6Q5GFD5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hs3st6Q5GFD5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hs3st6Q5GFD5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hs3st6Q5GFD5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hs3st6Q5GFD5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hs3st6Q5GFD5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hs3st6Q5GFD5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hs3st6Q5GFD5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hs3st6Q5GFD5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hs3st6Q5GFD5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hs3st6Q5GFD5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hs3st6Q5GFD5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hs3st6Q5GFD5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hs3st6Q5GFD5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hs3st6Q5GFD5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hs3st6Q5GFD5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms