Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a5Q4LDG0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc27a5Q4LDG0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc27a5Q4LDG0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a5Q4LDG0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a5Q4LDG0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a5Q4LDG0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc27a5Q4LDG0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc27a5Q4LDG0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc27a5Q4LDG0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a5Q4LDG0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a5Q4LDG0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a5Q4LDG0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a5Q4LDG0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a5Q4LDG0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc27a5Q4LDG0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a5Q4LDG0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a5Q4LDG0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a5Q4LDG0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a5Q4LDG0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc27a5Q4LDG0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a5Q4LDG0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc27a5Q4LDG0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc27a5Q4LDG0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc27a5Q4LDG0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc27a5Q4LDG0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc27a5Q4LDG0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc27a5Q4LDG0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc27a5Q4LDG0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a5Q4LDG0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a5Q4LDG0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a5Q4LDG0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc27a5Q4LDG0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc27a5Q4LDG0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc27a5Q4LDG0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc27a5Q4LDG0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc27a5Q4LDG0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc27a5Q4LDG0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc27a5Q4LDG0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc27a5Q4LDG0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc27a5Q4LDG0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc27a5Q4LDG0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc27a5Q4LDG0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms